Jeżeli układ klimatyzacji ulegnie całkowitemu uszkodzeniu, np. zniszczy się kompresor, to nie powinniśmy być zaskoczeni, że koszty naprawy mogą sięgać nawet kilku tysięcy złotych. Zazwyczaj koszt naprawy jest uzależniony przede wszystkim od rodzaju awarii, typu pojazdu a także typu samego układu klimatyzacji. Jeżeli trzeba wymienić kompresor z mechanicznym uszkodzeniem, to wówczas jednocześnie należy wymienić osuszacz oraz zawór rozprężny. Jeżeli chodzi o wymianę parownika - jest to niezwykle skomplikowane. Wymaga demontażu oraz ponownego zamontowania deski rozdzielczej. Koszt takiej naprawy mieści się między 1500 zł – 2000 zł w najtańszej wersji.
Podczas kontrolowania układu klimatyzacji wypompowuje się czynnik chłodniczy, który następnie oczyszcza się. Co dwa lata konieczna jest wymiana filtra-osuszacza. Za pomocą suchego azotu przedmuchuje się układ, pod wysokim ciśnieniem co jest przeprowadzane w celu usunięcia stałych zanieczyszczeń oraz wilgoci. Przegląda się też wszystkie elementy, kontroluje się złącza, przyłącza i różne elementy ruchome, również okablowanie i podzespoły sterowania oraz obsługi. Następnie ponownie napełnia się układ czynnikiem chłodzącym, którego ilość musi być odpowiednia dla danej konstrukcji. Raz na rok bądź, co 15 tysięcy km wymienia się filtr kabinowy. Przeprowadza się również test sprawdzający działanie oraz kontrolowanie szczelności całego układu. Na zakończenie dokumentuje się wynik wykonywanych prac.